Modelagem estrutural de alta confiança da metaloprotease GP63-like de Trypanosoma cruzi obtida por AlphaFold e validada por dinâmica molecular

Resumo

A glicoproteína de 63 kDa (TcGP63) é a principal metaloprotease de superfície de Trypanosoma cruzi e desempenha papel central nos processos de invasão celular e evasão imunológica. Apesar de sua relevância biológica, a estrutura tridimensional dessa enzima ainda não foi determinada experimentalmente. Neste estudo, a TcGP63 foi modelada utilizando o AlphaFold, e o modelo obtido foi avaliado quanto à qualidade estereoquímica, energética e conformacional. A estrutura predita apresentou altos valores de confiança (pTM = 0,93; pLDDT > 90), indicando robustez e acurácia do modelo. O motivo catalítico conservado HEXXH e o íon Zn²⁺ coordenado foram claramente identificados, com distâncias médias de coordenação compatíveis com outras metaloproteases da família das metzincinas. A validação dinâmica foi conduzida por meio de simulações de 25 ns com o campo de força GROMOS54a7. As análises de RMSD, raio de giro (Rg) e RMSF demonstraram estabilidade conformacional e compacidade estrutural ao longo da simulação, com flutuações localizadas apenas na extremidade C-terminal. Em conjunto, os resultados confirmam a integridade estrutural da TcGP63 e fornecem uma base sólida para estudos de docagem molecular e desenho racional de inibidores voltados ao controle da Doença de Chagas.